مأموریت مؤسسه (بیان فلسفۀ وجودی با لحاظ: خدمت گیرندگان، خدمات، حوزه جغرافیایی، مزیت‌های کلیدی، ارزش‌های سازمانی، توجه به انتظارات جامعه و فناوری):

«دانشگاه کوثر به عنوان دانشگاه جامع ویژۀ تربیت بانوان متخصص، متعهد و کارآفرین در شرق کشور، با تکیه بر آموزه‌های دین مبین اسلام، اسناد بالادستی و نیاز منطقه‌ای و   ملی، جذب اساتید و کارکنان متخصص و متعهد، طراحی و اجرای برنامه‌های بهبود سازمانی و مدیریتی هدف‌گرا، درصدد ارتقای دانش و مهارت بانوان و رفع نیازهای   آموزشی، پژوهشی، تربیتی و فرهنگی- اجتماعی آنان، انجام پژوهش‌های کاربردی و افزایش تولیدات علمی به منظور پاسخگویی به اهداف جامعۀ علمی، فرهنگی، اجتماعی و   اسلامی در سطح استانی و ملی از طریق ایجاد و توسعۀ فضای فیزیکی استاندارد و بهره‌مندی از امکانات و تجهیزات زیر ساختی و فناوری نوین لازم برای نایل شدن به   دانشگاهی برتر در سطح کشور و بین الملل تلاش می‌کند.»

مؤلفه­‌های کلیدی بیانیه رسالت دانشگاه کوثر:

خدمت گیرندگان:

جامعه علمی و بانوان متقاضی تحصیل در سطح آموزش عالی

حوزه‌­های فرهنگی و اجتماعی و اقتصادی جامعه

خدمات:

تربیت و آموزش بانوان متخصص، متعهد، کارآفرین، خلاق و پژوهشگر

حوزة جغرافیایی:

استانی، منطقه‌ای، ملی، بین­‌المللی

تعالی و بالندگی:

ایجاد فضای رشد علمی، تحقیقاتی، آموزشی و تربیتی

ارتقای جایگاه دانشگاه در سطح استانی، ملی و بین‌المللی  

فلسفۀ وجودی:

آموزش و تربیت بانوان جویای علم

تولید علم و پاسخگویی به نیازهای علمی، فرهنگی و اجتماعی جامعه

وی‍ژگی­های متمایز:

ویژه بانوان

توجه به انتظارات جامعه:

توجه به نیازهای علمی، فرهنگی و اجتماعی جامعه

مزیت‌های کلیدی:

توجه خاص به ارزش‌های سازمانی و اخلاقی، توانایی‌ها و علایق ویژۀ بانوان از دیدگاه علمی، فرهنگی، اجتماعی، دینی و ایجاد محیطی مناسب و آرام برای آموزش و پژوهش بانوان

ایجاد ظرفیت برای جامعۀ هدف (بانوان) آموزش عالی کشور

ایجاد بستر برای اجرای مفاد برنامه ششم توسعه کشور، سیاست‌های نظام و اسناد بالادستی در خصوص بانوان

پاسخگویی به نیازهای علمی ـ فرهنگی منطقه با عنایت به تعدد قومیتی آن

فناوری:

بهره‌گیری از فناوری‌های نوین در انجام امور

مشارکت در تولید و توسعۀ فناوری در سطوح منطقه­‌ای، ملی و بین ­المللی